V novějších verzích prohlížeče Internet Explorer je z bezpečnostních důvodů standardně zapnuta funkce blokování automaticky otevíraných oken. Protože aplikace používá otevírání nových oken pro zobrazování např. informativních dialogů, otevírání tiskových sestav apod., je pro správnou funkčnost nezbytné v prohlížeči funkci blokování automaticky otevíraných oken vypnout.
Pokud se při práci s aplikací setkáte s upozorněním, že bylo zablokováno automaticky otevírané okno (viz obrázek), bude nutné změnit nastavení této funkce. Nejjednodušší způsob je kliknutím pravým tlačítkem myši na žlutý pruh s upozorněním zobrazit místní nabídku, z ní vybrat volbu Vždy povolit automaticky otevíraná okna z tohoto webu a potvrdit ověřující dialog. Pro Internet Explorer 11 je volba správného nastavení zachycena na obrázku pod tímto textem.
Další možností je ruční přidání serveru aplikace mezi weby, které mají povolené automaticky otevírat nová okna. Volbou Nástroje -> Možnosti Internetu z hlavního menu otevřete dialog pro úpravu nastavení internetu a přejděte na záložku Osobní údaje. Zde tlačítkem Nastavení otevřete okno se seznamem povolených webů (viz obrázek), do vstupního pole zadejte adresu http://www.sherlogtrace.cz a stiskněte tlačítko Přidat.